![\"\"](\"http:\/\/sillon38.krycia.com\/userfiles\/image\/vache%20de%20dos.jpg\")
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La vache est le troisi\u00e8me animal domestique dont le g\u00e9nome est enti\u00e8rement s\u00e9quenc\u00e9, apr\u00e8s celui du poulet et du chien. Conduit par un consortium international, le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome bovin a n\u00e9cessit\u00e9 6 ann\u00e9es de travail et a impliqu\u00e9 plus de 300 scientifiques issus de 25 pays, pour le s\u00e9quen\u00e7age proprement dit mais surtout pour l\u2019assemblage, l\u2019annotation et l\u2019analyse des r\u00e9sultats.<\/p>\n
Ces travaux sont publi\u00e9s dans\u00a0 la revue \u00ab Science \u00bb de ce 24 avril. Il s’agit de la premi\u00e8re analyse d\u00e9taill\u00e9e de la s\u00e9quence du g\u00e9nome bovin, \u00e0 laquelle a contribu\u00e9 l\u2019INRA de Jouy-en-Josas. Des informations consid\u00e9rables sur la biologie de cette esp\u00e8ce et sur l\u2019\u00e9volution et l\u2019analyse compar\u00e9e des mammif\u00e8res. Un consortium international conduit par le Centre de s\u00e9quen\u00e7age du Baylor College of Medicine \u00e0 Houston (USA) publie dans la revue \u00ab SCIENCE \u00bb la premi\u00e8re analyse d\u00e9taill\u00e9e de la s\u00e9quence du g\u00e9nome bovin, \u00e0 laquelle a contribu\u00e9 l\u2019INRA de Jouy-en-Josas. Ce travail apporte des informations consid\u00e9rables sur la biologie de cette esp\u00e8ce et sur l\u2019\u00e9volution et l\u2019analyse compar\u00e9e des mammif\u00e8res. Il aura des applications nombreuses pour les fili\u00e8res bovines, en \u00e9largissant les outils et les crit\u00e8res pour la s\u00e9lection des animaux. Le d\u00e9tail de ces r\u00e9sultats est publi\u00e9 dans Science du 24 avril 2009.<\/p>\n
Outre la s\u00e9quence d\u2019une vache femelle de race Hereford parue dans un premier article, un second portant sur la structure des populations bovines d\u00e9crit plus sp\u00e9cifiquement le projet HapMap bovin, visant \u00e0 produire une cartographie de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique dans les diff\u00e9rentes populations, entre grands rameaux taurins et z\u00e9bus, et ce jusque dans les diff\u00e9rentes races bovines.<\/p>\n
Des r\u00e9sultats d\u00e9terminants pour comprendre l\u2019\u00e9volution des esp\u00e8ces Am\u00e9liorer les processus de s\u00e9lection des populations bovines<\/strong><\/p>\n Les connaissances acquises par ce s\u00e9quen\u00e7age ont des implications consid\u00e9rables pour les fili\u00e8res bovines tant pour le lait que pour la viande mais aussi en mati\u00e8re de reproduction ou d\u2019adaptation des esp\u00e8ces (robustesse, bien-\u00eatre), de techniques d\u2019\u00e9levage et d\u2019impacts environnementaux. La s\u00e9lection g\u00e9nomique des meilleures populations pratiqu\u00e9e par les \u00e9leveurs sera ainsi optimis\u00e9e. Elle consiste \u00e0 s\u00e9lectionner des reproducteurs sur la base de leur valeur g\u00e9n\u00e9tique pr\u00e9dite \u00e0 partir de marqueurs g\u00e9n\u00e9tiques r\u00e9partis sur tout le g\u00e9nome. Cette approche est rendue possible par la disponibilit\u00e9, pour un nombre croissant d\u2019esp\u00e8ces, de puces \u00e0 ADN constitu\u00e9es de 50 000 \u00e0 60 000 marqueurs.<\/p>\n Les donn\u00e9es issues du s\u00e9quen\u00e7age permettent le d\u00e9veloppement d\u2019un tr\u00e8s grand nombre de marqueurs g\u00e9n\u00e9tiques et d\u2019outils de g\u00e9notypage \u00e0 haut d\u00e9bit, renouvelant compl\u00e8tement les m\u00e9thodes de gestion des populations pour une s\u00e9lection de nouveaux caract\u00e8res. Ainsi les m\u00e9thodes d\u2019\u00e9levage pourront \u00eatre plus justement adapt\u00e9es \u00e0 la physiologie des animaux et de fait plus durables. L’ensemble de ces r\u00e9sultats est enti\u00e8rement disponible pour les scientifiques de tous pays par l’interm\u00e9diaire de bases de donn\u00e9es publiques. Le consortium international a permis l’acc\u00e8s \u00e0 la s\u00e9quence de la vache, depuis ao\u00fbt 2006, par l’interm\u00e9diaire de plusieurs sites internet qui ont d\u00e9j\u00e0 \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9s par les chercheurs, notamment pour la s\u00e9lection g\u00e9nomique. Le Consortium international conduit par diff\u00e9rentes institutions nord-am\u00e9ricaines (Baylor College, USDA, Universit\u00e9s) a \u00e9t\u00e9 financ\u00e9 principalement par des fonds nord-am\u00e9ricains (NHGRI, USDA, Etat du Texas, Genome Canada) ainsi que par quelques autres Etats (Australie, Nouvelle Z\u00e9lande, Norv\u00e8ge). Les associations de race, dont France Limousin S\u00e9lection, ont particip\u00e9 au financement du programme HapMap. L\u2019INRA a contribu\u00e9 par ses r\u00e9alisations pr\u00e9alables au s\u00e9quen\u00e7age, en particulier une carte physique compl\u00e8te du g\u00e9nome, par des cartes d\u2019irradiation de haute densit\u00e9, par la production de marqueurs g\u00e9n\u00e9tiques et par son travail d\u2019annotation. Ces donn\u00e9es sont le fruit d\u2019un long travail de cartographie d\u00e9but\u00e9 dans les ann\u00e9es 80 et qui a mobilis\u00e9 de nombreux chercheurs.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La vache est le troisi\u00e8me animal domestique dont le g\u00e9nome est enti\u00e8rement s\u00e9quenc\u00e9, apr\u00e8s celui du poulet et du chien. Conduit par un consortium international, le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome bovin a n\u00e9cessit\u00e9 6 ann\u00e9es de travail et a impliqu\u00e9 plus…<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[64],"tags":[2667,2959],"class_list":["post-6512","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-recherche-scientifique","tag-genome-bovin","tag-inra"],"yoast_head":"\n
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\nConclusion importante issue de ce s\u00e9quen\u00e7age, le g\u00e9nome bovin est beaucoup plus proche de celui de l\u2019homme que peut l\u2019\u00eatre celui de la souris ou du rat. Il comprend au moins 22 000 g\u00e8nes, dont la plupart se retrouvent chez l\u2019homme. La majorit\u00e9 des chromosomes bovins correspondent \u00e0 de grands fragments de chromosomes humains, parfois des chromosomes entiers. La grande conservation du g\u00e9nome entre ces deux esp\u00e8ces est expliqu\u00e9e par l\u2019existence d\u2019un anc\u00eatre commun \u00e0 l\u2019homme et au bovin remontant \u00e0 environ 95 millions d\u2019ann\u00e9es. Les r\u00e9arrangements survenus ult\u00e9rieurement sont principalement localis\u00e9s dans les g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans l\u2019immunit\u00e9, le m\u00e9tabolisme et la digestion. Ces changements pourraient expliquer l\u2019efficacit\u00e9 des ruminants \u00e0 convertir des fourrages pauvres \u00e9nerg\u00e9tiquement en viande et lait.
\nEn parall\u00e8le du s\u00e9quen\u00e7age, le projet HapMap bovin, a dessin\u00e9 une cartographie de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique dans les diff\u00e9rentes populations bovines. L\u2019analyse de pr\u00e8s de 500 animaux de 17 populations, y compris la race fran\u00e7aise Limousine, montre que les bovins constituaient une population originelle tr\u00e8s diverse qui s\u2019est structur\u00e9e sous l\u2019effet de la domestication, la formation des races et la s\u00e9lection. La diversit\u00e9 globale reste cependant aujourd\u2019hui consid\u00e9rable sur l\u2019ensemble de l\u2019esp\u00e8ce bovine. Depuis la domestication il y a 8000 \u00e0 10 000 ans, la conduite des populations de bovins par l\u2019homme a d\u00e9bouch\u00e9 aujourd\u2019hui sur plus de 800 races d\u2019aptitudes vari\u00e9es. Les z\u00e9bus sont plus diversifi\u00e9s que les taurins, ce qui est coh\u00e9rent avec l\u2019hypoth\u00e8se de foyers de domestication distincts et d\u2019une base initiale plus large pour les z\u00e9bus.<\/p>\n
\nLa connaissance du g\u00e9nome va aussi faciliter l’identification des mutations responsables de pathologies chez les bovins.<\/p>\n
\nLes chercheurs vont d\u00e9sormais continuer \u00e0 explorer en profondeur cette s\u00e9quence.<\/p>\n